Bioinformatics
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=== Conferances === | === Conferences === |
Semaine du 5 Avril 2010 |
38:30 h |
CNSTN |
salle polyvalente |
Planning
Lundi (9-17h): introduction générale sur Ubuntu et le logiciel libre - install party
Mardi (8-12h): Manipulation de fichiers contenants des données biologiques sous shell
Mercredi (8-12h): apprendre les différentes façons d'installer un programme sous Ubuntu
Jeudi (8-12h): Comparaison et alignement de séquences de protéines/ADN
Samedi (10-13h): Prédiction des structures tridimensionnelles en se basant sur l'homologie des séquences dans les bases de données PDB.
La semaine qui suit: Interactomique et docking (en cours)
Conferences
Conférence |
Animateur |
Confirmation Animateur |
Besoins |
Confirmation du Materiels |
Commentaires |
Introduction à la Bioinformatique |
karim Mezhoud |
ok |
vidéo projecteur |
ok |
Commentaires |
GNU/Linux et le logiciel libre |
karim Mezhoud |
ok |
vidéo projecteur |
ok |
Commentaires |
Ubuntu et sa communauté |
karim Mezhoud |
ok |
vidéo projecteur |
ok |
Commentaires |
Utilité d'Ubuntu pour les Biologistes |
karim Mezhoud |
ok |
vidéo projecteur |
ok |
Commentaires |
Modélisation des interactions Protéines-ADN |
Rafik Ouerchfeni |
en cours |
vidéo projecteur |
ok |
Commentaires |
Ateliers
Atelier |
Animateur |
Confirmation Animateur |
Besoins |
Confirmation du Materiels |
Commentaires |
installation d'ubuntu |
karim Mezhoud |
ok |
11 PC |
OK |
La salle polyvalente du CNSTN nous met à notre disposition 11 PC pour l'installation d'ubuntu pour les participants |
Manipulation de fichier sous shell |
karim Mezhoud |
ok |
11 PC |
OK |
usage de commande de base sous shell pour extraire des informations biologiques contenues dans les bases de données |
installation de programme manuellement sous Ubuntu |
karim Mezhoud |
ok |
11 PC |
OK |
dans cette partie des programmes installés sont spécifiques pour la manipulation et visualisation des protéines |
Interactomique des proétines |
karim Mezhoud |
ok |
11 PC |
OK |
dans cette partie des programmes installés sont spécifiques pour la manipulation et la visualisation des interactions entre protéines |
Prédiction des cibles moléculaires des produits pharmaceutiques |
karim Mezhoud |
ok |
11 PC |
OK |
docking et recherche des cibles moléculaires des médicaments |
Équipes
L'quipe est constituée de: Karim Mezhoud: organisateur de la formation Ubuntu pour les biologistes
Rafik Ouerchfeni: participe à toute la formation (installation Bioinformatique)
Wahid Mèjri: participe à toute la formation (logistique et installation)
kmezhoud/Bioinformatics (last edited 2012-12-22 12:08:11 by kmezhoud)