Bioinformatics

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|| Semaine du 5 Avril 2010|| 38:30 h ||
|| CNSTN || salle polyvalente ||

|| Nbr d'heures|| 38:30 h ||
|| Lieu || Centre National des Sciences et technologies Nucléaires ||

Nbr d'heures

38:30 h

Lieu

Centre National des Sciences et technologies Nucléaires

Planning

Lundi (9-17h): introduction générale sur Ubuntu et le logiciel libre - install party

Mardi (8-12h): Manipulation de fichiers contenants des données biologiques sous shell

Mercredi (8-12h): apprendre les différentes façons d'installer un programme sous Ubuntu

Jeudi (8-12h): Comparaison et alignement de séquences de protéines/ADN

Samedi (10-13h): Prédiction des structures tridimensionnelles en se basant sur l'homologie des séquences dans les bases de données PDB.

La semaine qui suit: Interactomique et docking (en cours)

Conferences

Conférence

Animateur

Confirmation Animateur

Besoins

Confirmation du Materiels

Commentaires

Introduction à la Bioinformatique

karim Mezhoud

ok

vidéo projecteur

ok

Commentaires

GNU/Linux et le logiciel libre

karim Mezhoud

ok

vidéo projecteur

ok

Commentaires

Ubuntu et sa communauté

karim Mezhoud

ok

vidéo projecteur

ok

Commentaires

Utilité d'Ubuntu pour les Biologistes

karim Mezhoud

ok

vidéo projecteur

ok

Commentaires

Modélisation des interactions Protéines-ADN

Rafik Ouerchfeni

en cours

vidéo projecteur

ok

Commentaires

Ateliers

Atelier

Animateur

Confirmation Animateur

Besoins

Confirmation du Materiels

Commentaires

installation d'ubuntu

karim Mezhoud

ok

11 PC

OK

La salle polyvalente du CNSTN nous met à notre disposition 11 PC pour l'installation d'ubuntu pour les participants

Manipulation de fichier sous shell

karim Mezhoud

ok

11 PC

OK

usage de commande de base sous shell pour extraire des informations biologiques contenues dans les bases de données

installation de programme manuellement sous Ubuntu

karim Mezhoud

ok

11 PC

OK

dans cette partie des programmes installés sont spécifiques pour la manipulation et visualisation des protéines

Interactomique des proétines

karim Mezhoud

ok

11 PC

OK

dans cette partie des programmes installés sont spécifiques pour la manipulation et la visualisation des interactions entre protéines

Prédiction des cibles moléculaires des produits pharmaceutiques

karim Mezhoud

ok

11 PC

OK

docking et recherche des cibles moléculaires des médicaments

Équipes

L'quipe est constituée de: Karim Mezhoud: organisateur de la formation Ubuntu pour les biologistes

Rafik Ouerchfeni: participe à toute la formation (installation Bioinformatique)

Wahid Mèjri: participe à toute la formation (logistique et installation)

kmezhoud/Bioinformatics (last edited 2012-12-22 12:08:11 by kmezhoud)